An image processing pipeline to segment iris for unconstrained cow identification system

One of the most evident costs in cow farming is the identification of the animals. Classic identification processes are labour-intensive, prone to human errors and invasive for the animal. An automated alternative is an animal identification based on unique biometric patterns like iris recognition; in this context, correct segmentation of the region of interest becomes of critical importance. This work introduces a bovine iris segmentation pipeline that processes images taken in the wild, extracting the iris region. The solution deals with images taken with a regular visible-light camera in real scenarios, where reflections in the iris and camera flash introduce a high level of noise that makes the segmentation procedure challenging. Traditional segmentation techniques for the human iris are not applicable given the nature of the bovine eye; at this aim, a dataset composed of catalogued images and manually labelled ground truth data of Aberdeen-Angus has been used for the experiments and made publicly available. The unique ID number for each different animal in the dataset is provided, making it suitable for recognition tasks. Segmentation results have been validated with our dataset showing high reliability: with the most pessimistic metric (i.e. intersection over union), a mean score of 0.8957 has been obtained.Fil: Larregui, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; ArgentinaFil: Cazzato, Dario. : University Of Luxembourg; Luxemburgo. Interdisciplinary Centre For Security Reliability And T; LuxemburgoFil: Castro, Silvia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentin

Serological Survey of Antibodies to Mannheimia haemolytica and Pasteurella multocida in Camelids from Argentina

South American camelids are a source of livestock wealth in Andean countries. In Argentina,there is little information about camelid pathogens, and most of the literature data available areseroprevalence works against virus. Besides, little is known about the immunological status againstbacterial agents affecting these animals. In an effort to explore the serological status of Argentineancamelids, we evaluated the presence of serum antibodies against bacterial pathogens involved inpneumonic diseases (Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica) in llamas from differentregions of the country. By ELISA, a high seroprevalence for both pathogens was found in the serumsamples; higher optical density (OD) values were obtained when the sera were incubated with heatkilledP. multocida as coating antigen compared to M. haemolytica. In addition, a large number ofsera analyzed presented high OD values for both microorganisms independently of their originregion. Serum avidity was also evaluated, by means of an assay based on antibody desorption byurea. No correlation was found between the high ODs obtained for P. multocida and the serumavidity. On the other hand, samples reacting with M. haemolytica had lower OD values but higheravidity index. The antigenic recognition pattern for both microorganisms was determined bywestern blot. Unlike P. multocida, the antigenic recognition pattern of M. haemolytica did not differamong serum samples obtained from animals living in different areas. In summary, we found thatcamelids can synthetize antibodies that recognize M. haemolytica with high avidity for differentantigens of the bacterium, suggesting that Argentinean camelids are in contact with M. haemolyticawhich is probably a causative agent of subclinical infections. Conversely, specific antibodies forP. multocida were also found, but these sera presented low avidity that is probably the result of acolonization process by this bacterium, or else, to be a consequence of cross-reactivity phenomenaFil: Díaz, Ailén Magalí. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Ledesma, Martin Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Calcagno, M. L.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Físico Matemática. Cátedra de Matemáticas; ArgentinaFil: Leoni, Juliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Manghi, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Canellada, Andrea Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Castro, Marisa Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; Argentin

Formación de nuevos enlaces C-C y C-S, mediante reacciones catalizadas por cobre y por transferencia electrónica

Tesis (Doctora en Ciencias Químicas) - -Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2015Este trabajo de Tesis estuvo enfocado al estudio de nuevas estrategias sintéticas que involucren tanto reacciones catalizadas por Cu, como procesos de sustitución nucleofílica por TE. Se hizo énfasis en la aplicación de estas reacciones a la formación de nuevas uniones C-C y C-S. En el Capítulo 2, se informa un estudio de las reacciones de arilación catalizadas por Cu, aplicadas a la formación de nuevos enlaces C-S. Así, se desarrolla los resultados obtenidos en la síntesis de tioacetatos de arilo, por medio de una reacción de acoplamiento CAr-S catalizada por sales de Cu, entre halogenuros de arilo y la sal de potasio del anión tioacetato. Luego, se exploró el empleo de los mismos como intermediarios para la obtención one-pot de diferentes compuestos azufrados, tales como: alquil-aril sulfuros, diaril sulfuros, disulfuros y heterociclos azufrados de cinco miembros. También, se trabajó utilizando tiourea como nucléofilo de azufre en las reacciones de arilación CAr-S catalizadas por Cu, empleando esta metodología para la formación directa de diaril sulfuros y heterociclos. En el Capítulo 3 se describe el desarrollo de una estrategia sintética que permite obtener heterociclos de seis miembros derivados del núcleo 1,3-benzotiacina, empleando las reacciones de arilación CAr-S catalizadas por Cu. Como metodología se plantea reacciones tándem en cascada de acoplamiento intermolecular catalizado por Cu para la formación de enlaces CAr-S, seguidas de una reacción de ciclización polar. A su vez, se evalúa la eficiencia de un proceso one-pot acoplando la síntesis de los precursores, con las reacciones posteriores de introducción del átomo de azufre y cierre de anillo. En el Capítulo 4 se detalla la investigación realizada acerca del mecanismo de las reacciones de arilación C-S catalizadas por sales de Cu. Para tal fin, se examinó la formación, el estado de oxidación y la identidad de los complejos intermediarios involucrados, y se utilizaron, como herramientas de análisis, diferentes métodos electroquímicos y espectroscópicos. En el Capítulo 5, se describe un estudio de reacciones de TE inducidas por irradiación de microondas. Específicamente, se desarrolló un procedimiento para llevar a cabo la α-arilación de aril metilcetonas, por medio de la sustitución de haloarenos, usando enolatos de cetonas como especies nucleofílicas, en un proceso de SRN1 iniciado térmicamente. Asimismo, dicha metodología se aplicó a la formación one-pot de heterociclos de nitrógeno, por reacciones de SRN1 intra- e intermoleculares. Finalmente, en el Capítulo 6 se discuten las conclusiones generales y en el Capítulo 7 se informa en detalle los aspectos experimentales inherentes a todo el trabajo de Tesis realizado.Fil: Soria Castro, Silvia M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentina.Fil: Peñeñory, Alicia Beatriz. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Orgánica; Argentina.Fil: Martin, Sandra Elizabeth. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Orgánica; Argentina.Fil: Martin, Sandra Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoquímica de Córdoba; Argentina.Fil: Mazzieri, María Rosa. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Ciencias Farmaceúticas. Centro de Información de Medicamentos; Argentina.Fil: Moyano, Elizabeth Laura. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Orgánica; Argentina.Fil: Moyano, Elizabeth Laura. Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoquímica de Córdoba; Argentina.Fil: Radivoy, Gabriel Eduardo. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Química; Argentina

Combining Defects in a Single Nanographene: A Fully Helical Saddle Ribbon

The controlled preparation of well-defined distorted nanographenes by a bottom-up approach based on organic synthesis permits the direct establishment of unprecedented structure–property relationships in carbon nanostructures. The simultaneous incorporation of various defects in nanographenes affords highly curved structures with novel or enhanced photophysical properties. In this sense, we recently reported a fully helical and saddle-shaped nanographene ribbon containing the first undecabenzo[7]helicene unit. Both its linear and nonlinear optical properties are enhanced in comparison with those of other partially π-extended [7]helicenes. Moreover, the new superhelicene exhibits the highest emission dissymmetry factor (glum) reported to date for a homochiral nanographene. The combination of both nonlinear and chiroptical properties in nanographenes opens up new possible future applications for those distorted nanostructures.This work was supported by the European Research Council (ERC) under the European Union´s Horizon 2020 research and innovation program (ERC-2015-STG-677023) and the Ministerio de Economía y Competitividad (Spain) (CTQ2015-70283-P, BES-2016-076371, IJCI2016-27793 and RyC-2013-12943). E.M. thanks the Fundação para a Ciência e a Tecnologia for financial support (UID/NAN/50024/2013 and IF/00759/2013) (

Understanding the Heteroatom Effect on the Ullmann Copper-Catalyzed Cross-Coupling of X-Arylation (X = NH, O, S) Mechanism

Density Functional Theory (DFT) calculations have been carried out in order to unravel the governing reaction mechanism in copper-catalyzed cross-coupling Ullmann type reactions between iodobenzene (1, PhI) and aniline (2-NH, PhNH2), phenol (2-O, PhOH) and thiophenol (2-S, PhSH) with phenanthroline (phen) as the ancillary ligand. Four different pathways for the mechanism were considered namely Oxidative Addition–Reductive Elimination (OA-RE), σ-bond Metathesis (MET), Single Electron Transfer (SET), and Halogen Atom Transfer (HAT). Our results suggest that the OA-RE route, involving CuIII intermediates, is the energetically most favorable pathway for all the systems considered. Interestingly, the rate-determining step is the oxidative addition of the phenyl iodide to the metal center regardless of the nature of the heteroatom. The computed energy barriers in OA increase in the order O < S < NH. Using the Activation Strain Model (ASM) of chemical reactivity, it was found that the strain energy associated with the bending of the copper(I) complex controls the observed reactivity

Undecabenzo[7]superhelicene: a helical nanographene ribbon as CPL emitter

We report the synthesis and characterization of an enantiopure superhelicene nanographene constituted by two saddleshaped and one planar hexabenzocoronene (HBC) units arranged in a helicoidal shape. This is, to the best of our knowledge, the first undecabenzo[7]carbohelicene, i.e., the first fully π-extended [7]helicene. Racemic resolution allowed its chiroptical properties analysis revealing dissymmetry factors in the range of 2×10-3 both in the absorption and in the emission measurements. Remarkably, nonlinear photophysical analysis showed two-photon absorption crosssection of 870 GM at 800 nm and a perfect overlapping between linear, non-linear and chiral emission.-European Research Council (ERC-2015-STG-677023) -Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO, Spain): CTQ2015-70283-P -Fundacao para a Ciencia e a tecnologia, Portugal: UID/NAN/50024/2013, IF/00759/2013 -Universidad de Granad

A triskelion-shaped saddle-helix hybrid nanographene

A unique rippled nanographene constituted by 52 fused rings is presented in which six out-of-plane motifs are fully fused into a triangular aromatic surface of ca. 2.5 nm size. Three units of an unprecedented fully lateral π-extended octabenzo[5]helicene together with three units of saddle-shaped heptagonal rings are combined in a single structure leading to a well-soluble warped nanographene. The two pairs of possible enantiomers have been isolated and their linear, non-linear and chiroptical properties evaluated, revealing an outstanding quantum yield and brightness values at low energy together with good chiroptical responses both in the absorption and emissionWe acknowledge the European Research Council (ERC) under the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program (ERC-2015-STG-677023) and the Ministerio de Economía y Competitividad (MINECO, Spain) (CTQ2015-70283- P, UNGR15-CE-3478, BES-2016-076371 and RyC-2013-12943). E.M. thanks the Fundação para a Ciência e a tecnologia (PTDC/NAN-MAT729317/2017 and PTDC/QUI-QFI/29319/2017). We thank the CSIRC-Alhambra from the University of Granada

Chemotactic response of the flavonoid daidzein and its effect on the composition of the rumen bacterial community

Daidzein is one of common metabolites in plants and has chemotactic effect on soil bacteria that colonize the plants. There are several tests to assess bacterial chemotaxis, but none focused on rumen bacteria. Therefore, the aim of this study was to test the chemotactic response of the rumen microflora towards daidzein using a standardized bacterial chemotaxis assay. It consisted in a modifying capillary technique and employing technology for measuring in vitro gas production. Ruminal fluids and cellulose were used as controls. The response of bacteria to daidzein was greater than the response to cellulose, supporting the hypothesis that when fodder is chewed by the ruminant it releases daidzein which can attract rumen bacteria towards feed particles (chemotaxis) for attachment and subsequent degradation

Malignant osteopetrosis: bone marrow transplantation

A osteopetrose é uma osteopatia hereditária caracterizada pela deficiência na reabsorção óssea que ocorre por disfunção dos osteoclastos. Com o acúmulo de material osteóide que oblitera o canal medular, ocorre hematopoiese extramedular (hepato-esplenomegalia), obliteração dos forames dos nervos cranianos (cegueira, surdez, paralisias faciais), macrocefalia, protusão da fronte, hipertelorismo, exoftalmo, aumento da pressão intracraniana, retardo na erupção dentária, atraso no crescimento, atraso no desenvolvimento neuropsicomotor, e a morte ocorre precocemente nos primeiros anos de vida. A única alternativa terapêutica curativa é o transplante de medula óssea (TMO) de doador HLA idêntico, pois restabelece a hematopoiese e a função monócito-macrófago, com melhora das lesões ósseas e anormalidades hematopoiéticas, embora não reverta as alterações sensoriais já instaladas. Os autores relatam casos de duas crianças portadoras de osteopetrose maligna submetidas ao transplante de medula óssea com sucesso. A primeira encontra-se no dia +1260 do TMO, com melhora evidente da radiologia esquelética, sem progressão das deficiências neurológicas que apresentava, e com biópsia óssea sem sinais de osteopetrose. O segundo paciente encontra-se no dia + 700, com sinais de reabsorção óssea e sem progressão dos danos neurológicos. Os autores chamam a atenção para a necessidade de diagnóstico precoce da osteopetrose e o rápido encaminhamento para o transplante de medula óssea antes da instalação de seqüelas neurológicas definitivas.Osteopetrosis is an inherited disorder characterized by the inability to reabsorb and remodel bone due to osteoclast dysfunction. The encroachment by bone and mineralized cartilage of the medullary cavities leads to extramedullary hematopoiesis (hepatosplenomegaly) and cranial-nerve foramina leads to blindness, auditory nerve damage, and occulomotor and facial nerve palsies. Defective bone re-absorption also leads to macrocephaly, frontal bossing, hypertelorism, exophthalmos, increased intracranial pressure, retarded tooth eruption, retarded linear growth and psychomotor delay. Death occurs within the first years of life. The only curative therapy is allogeneic bone marrow transplantation with a HLA-identical donor, which restores hematopoiesis, monocyte-macrophage function and bone recovery, but there is no sensorial deficit restoration once present. The authors report two cases of allogeneic bone marrow transplant for infantile malignant osteopetrosis. The first child, on day 1260 after bone marrow transplantation (BMT), showed radiologic bone recovery and no progression of neurological deficits with a bone biopsy showing no signs of osteopetrosis. The second child showed signs of bone re-absorption and no progression of neurological deficits on day 700. The authors emphasize the importance of early diagnosis of osteopetrosis and the necessity of bone marrow transplantation before neurological deficits have begun

Visualización de grandes volúmenes de datos

La disponibilidad de almacenamiento económico y el progreso tecnológico, han llevado a que se hayan creado inmensas bases de datos de negocios, de datos científicos, de datos meteorológicos entre otros tipos de datos. Ante el crecimiento tan vertiginoso en la cantidad de información de estas bases de datos y aún cuando las personas estén acostumbradas a interrogarlas, se hace prácticamente imposible para una persona la tarea de explorarlas para poder extraer conclusiones, tendencias y patrones. En este caso, sin duda los problemas de la consulta y la posterior exploración de las bases de datos son problemas clave. Con el objetivo de colaborar en la solución de los mismos se han desarrollado distintas herramientas de visualización. Entre las primeras propuestas para la visualización de este tipo de información, surgen métodos interactivos basados en técnicas de browsing, de filtros y de facilidades para la construcción de consultas dinámicas que permitan aprender de los datos a través de múltiples consultas. Las propuestas de investigación más ambiciosas y recientes son las de data mining visual y están vinculadas con una nueva visión de la información en grandes bases de datos. Se pretende la búsqueda de nuevos conocimientos o profundización del discernimiento de conocimientos existentes, a través de un esfuerzo cooperativo entre el hombre y la computadora. Se basan en algoritmos de clustering guiados con técnicas de visualización interactivas para descubrir comportamientos y tendencias en los datos. Informalmente, visualización es la transformación de datos o información en imágenes o pinturas. La visualización emplea el aparato sensitivo primario humano, que es la visión, tanto como todo el poder de procesamiento de la mente humana. El resultado debe ser un medio simple y efectivo para comunicar información voluminosa y compleja. En este contexto, el objetivo de nuestro trabajo consiste en delinear criterios con el objetivo de obtener una visualización efectiva de grandes bases de datos en equipos de bajo costo. En este trabajo presentamos una descripción de la investigación realizada sobre las tendencias y herramientas que se están utilizando para el discernimiento de grandes volúmenes de datos en Ciencias de la Computación. En la sección siguiente se detallan los conceptos fundamentales involucrados en visualización, visualización de información, data mining visual y cómo se relacionan a través de la representación gráfica de los datos. En la sección siguiente se presentan algunos ejemplos de visualización de bases de datos y se concluye con una descripción del trabajo a realizar.Eje: Computación gráfica. VisualizaciónRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI